負損耗表示光纖鏈路不光沒有損耗，反而還有“增益” — 當然這是不真實的。主要原因來自于以下各種偏差和誤差。

其一，在光源端口，光能量不都是 100%射入測試跳線中的，其“耦合效率”的高低與端口結構的幾何尺寸和幾何偏差有關，且與測試跳線插頭的幾何尺寸的“偏差”也有關。所以，歸零以后一般不允許再插拔測試跳線，否則會破壞端口耦合效率，如若不小心拔出了跳線，則必須重新歸零，只有這樣才能避免增大測試誤差。對短鏈路而言，歸零后插拔端口跳線會令損耗增加或“減少” — 這導致出現(xiàn)測試結果為“負損耗”的現(xiàn)象。

其二，如果歸零時跳線端面附著有纖維屑或灰塵，但歸零后脫落，也可能會出現(xiàn)“負損耗”。

其三，開機未預熱就歸零，因儀器工作參數(shù)漂移而出現(xiàn)“負損耗”。一般建議預熱5 分鐘，溫差較大時應預熱 10 分鐘。

其四，歸零時跳線插拔不到位(損耗偏大)。

其五，如果歸零用的耦合器本身偏差較大(比如軸向對準偏差較大)，則歸零后測試短鏈路時也可能會出現(xiàn)負損耗。

其六，劣質測試跳線或跳線本身不穩(wěn)定。